2008年，北京奥运会后，刚晋升到国家一队的马晋顶替退役的高崚，成为老将郑波的新混双搭档，这对新组合首次出战11月举行的中国公开赛。在比赛之前，马晋和郑波仅合练了两三次，但却无阻他们在赛场上的优异发挥；在年末举行的两项超级系列赛－中国公开赛和香港公开赛上，郑/马均能打进四强，只分别败在队友徐晨/赵芸蕾和张亚雯/谢中博的拍下，没有败过给任何一对外国选手。
2010年，马晋与郑波的混双世界排名在第3周曾一度升上*一位；然而，郑波其后却因纪律问题而被教练调回省队。在郑波离队期间，马晋专心主攻女双，并夺得德国公开赛冠军和马来西亚超级赛亚军；但在5月进行的尤伯杯决赛的关键时刻，她与王晓理的组合竟不敌韩国对手，间接令中国队失落了连夺多届的尤伯杯。面对着职业生涯的低谷，已合作两年的郑波却在这时获教练恩准归队；由于搭档接下了“只有在拿冠军才能回国家队”的命令，二人在这次世锦赛承受前所 未有的压力。虽然如此，郑/马仍能及时回复水准，先后淘汰戍革·普拉帕卡莫/莎拉丽·桑松卡姆、诺瓦·维迪安托/利利亚纳·纳西尔及高成炫/河贞恩等种子选手，杀入决赛；并在决赛中以21:14、21:10直落两局战胜队友何汉斌/于洋夺冠，协助中国队自2001年后首次赢得世锦赛混双冠军。此外，马晋亦在同届世锦赛中联同王晓理，以头号种子身分杀入女双决赛，最终败于队友、奥运金 牌组合杜婧/于洋，未能实现世锦赛的双冠美梦。

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